Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa5P28312 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa5P28312 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms