Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PdgfraP26618 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms