Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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