Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkchP23298 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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