Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms