Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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RarbP22605 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RarbP22605 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RarbP22605 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RarbP22605 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RarbP22605 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RarbP22605 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RarbP22605 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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