Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ntf3P20181 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms