Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18532 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18532 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18532 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms