Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms