Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18528 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18528 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P18528 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18528 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P18528 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18528 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18528 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18528 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18528 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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