Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18525 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18525 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18525 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms