Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Hoxb1P17919 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb1P17919 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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