Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Sptan1P16546 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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