Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms