Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P10404 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P10404 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P10404 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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