Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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