Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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