Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lnx1O70263 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms