Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms