Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Cnih1O35372 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cnih1O35372 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms