Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ColqO35348 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ColqO35348 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms