Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms