Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm21887J3QQ04 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm21887J3QQ04 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm21887J3QQ04 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm21887J3QQ04 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm21887J3QQ04 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm21887J3QQ04 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm21887J3QQ04 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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Gm21887J3QQ04 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm21887J3QQ04 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms