Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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