Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms