Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20825J3QM67 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms