Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms