Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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