Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Taf4bG5E8Z2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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