Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r34G3XA52 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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