Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnmal2G3X9N3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms