Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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