Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms