Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms