Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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