Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms