Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3250E9Q1M3 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms