Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc17E9PVB5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms