Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Clip3B9EHT4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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