Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms