Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtprbB2RU80 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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