Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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