Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plcb2A3KGF7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plcb2A3KGF7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms