Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms