Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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