Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JDU3

Igkv20-101-2, Immunoglobulin kappa chain variable 20-101-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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