Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac5Q9Z2V6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Hdac5Q9Z2V6 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac5Q9Z2V6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms