Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms