Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim44Q9QXA7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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