Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdcQ9QW08 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms